Uticaj polimorfizma ACE2, IFNL3 i IFNL4 gena na težinu kliničke slike i ishod COVID-19
Association of ACE2, IFNL3 and IFNL4 Gene Polymorphisms with COVID-19 Severity and Outcome
Докторанд
Matić, SanjaМентор
Baskić, DejanЧланови комисије
Đorđević, NatašaTodorović, Danijela
Popović, Suzana
Todorović, Zoran
Метаподаци
Приказ свих података о дисертацијиСажетак
Uvod: Brojni faktori domaćina, uklučujući i genetičke polimorfizme, mogu uticati na
kompleksan mehanizam različitih infektivnih bolesti, poput COVID-19. Genotipizacijom
funkcionalnih polimorfizama relevantnih gena u izloženim populacijama mogu se
identifikovati genetički prediktori teške bolesti i smrtnog ishoda.
Cilj: Studija ima za cilj da utvrdi povezanost prisustva polimorfizama ACE2, IFNL3 i IFNL4
gena, kao i koncentracija sACE2, IFN-λ3 i IFN-λ4 u serumu, sa težinom bolesti i ishodom
COVID-19.
Ispitanici i metode: Ova opservaciona studija obuhvatila je 178 hospitalizovanih pacijenata sa
SARS-CoV-2 infekcijom. Genotipizacija polimorfizama ACE2, IFNL3 i IFNL4 izvršena je
Real-Time PCR metodom, dok su serumski nivoi sACE2, IFN-λ3 i IFN-λ4 na prijemu određeni
ELISA metodom.
Rezultati: Prisustvo varijantnog alela ACE2 rs2106809 kod žena donosi 12 puta veći rizik od
teške forme bolesti, ali i 10 puta manji rizik od kritično teške i smrtnog ishoda. Varijantni aleli
IFNL3 (rs8099917 i rs1...2980275) i IFNL4 (rs12979860 i rs368234815) smanjuju rizik od
umerene infekcije najmanje 5 puta. Prisustvo oba varijantna alela bilo kog ispitivanog IFNL4
polimorfizma smanjuje rizik od pneumonije kod žena 29 puta i smrtnog ishoda za 93,6%. Šansa
za smrtni ishod veća je kod nosilaca varijantnog alela IFNL3 rs8099917. Niži nivoi IFN-λ3 i
viši nivoi sACE2 u serumu pacijenata na prijemu ukazuju na povećan rizik od ozbiljnijih
kliničkih manifestacija i smrtnog ishoda infekcije SARS-CoV-2.
Zaključak: Polimorfizmi ACE2, IFNL3 i IFNL4, kao i serumske koncentracije sACE2 i IFNλ3 na prijemu, povezani su sa težinom i ishodom COVID-19. Genotipizacija ovih gena i
merenje serumskih nivoa njihovih produkata u ranim fazama infekcije mogu pomoći u proceni
rizika od progresije bolesti i smrtnog ishoda.
Introduction: Host factors, including genetic polymorphisms, impact the mechanisms of
infectious diseases such as COVID-19. Genotyping exposed populations for functional
polymorphisms of relevant genes might predict severe disease and fatal outcome.
Aim: This research explores the association of ACE2, IFNL3, and IFNL4 gene polymorphisms
and the sACE2, IFN-λ3, and IFN-λ4 serum levels with COVID-19 severity and outcome.
Participants and methods: This observational study included 178 hospitalized patients with
SARS-CoV-2 infection. Genotyping of ACE2, IFNL3, and IFNL4 polymorphisms was
performed by the Real-Time PCR method; serum levels of sACE2, IFN-λ3, and IFN-λ4 were
determined upon admission using the ELISA method.
Results: The variant allele of ACE2 rs2106809 in females indicates a 12-fold higher risk of
severe disease and a 10-fold lower risk of critical severity and fatal outcome. IFNL3 (rs8099917
and rs12980275) and IFNL4 (rs12979860 and rs368234815) variant alleles are associated... with
at least a 5-fold reduced risk of moderate disease. Both variant alleles of any IFNL4
polymorphisms are linked to a 29-fold lower risk of pneumonia in females and a 93.6%
diminished risk of fatal outcome. The chance of a fatal outcome is higher in carriers of the
IFNL3 rs8099917 variant allele. Lower IFN-λ3 and higher sACE2 levels in patients' serum at
hospital admission indicate an increased risk of severe and fatal SARS-CoV-2 infection.
Conclusion: ACE2, IFNL3, and IFNL4 polymorphisms, along with serum concentrations of
sACE2 and IFN-λ3 upon hospital admission, correlate with the COVID-19 severity and
outcome. Genotyping these genes and measuring their product serum levels during the early
stages of infection could assist in assessing the risk of disease progression and fatal outcome.