Struktura topološki zatvorene ORI sekvence dihidrofolatreduktaznog lokusa u interakciji sa inicijacionim proteinom ORC
Structure of topologically closed ORI sequence from dihydrofolate reductase locus in interaction with initiation protein ORC
Doktorand
Tomić, Branko V.Mentor
Kušić-Tišma, JelenaČlanovi komisije
Brajušković, GoranBrajušković, Goran
Stefanović, Dragana
Radojković, Dragica
Metapodaci
Prikaz svih podataka o disertacijiSažetak
Replikacija je jedan od osnovnih procesa u životnom ciklusu ćelije. Cilj
replikacije je udvajanje genetičkog materijala. Da bi genetički materijal bio pravilno
umnožen i kasnije razdvojen na ćerke ćelije, razvijen je veliki broj mehanizama
regulacije replikacije. Jedan od načina regulacije je pravilan izbor i aktivacija mesta
inicijacije replikacije.
Broj i kompleksnost mesta inicijacije replikacije varira među vrstama. Kod
evolutivno nižih eukariota su jednostavnija, dok su kod viših eukariota
kompleksnija. Način prepoznavanja ovih mesta od strane inicijacionih proteina nije
u potpunosti razjašnjen.
Ori sekvenca, locirana nizvodno od gena DHFR (dihidrofolat reduktaza)
hrčka, sadrži tri definisana ori mesta inicijacije replikacije: ori β, ori β' i ori γ. Ori β
sekvenca DHFR je jak replikator i pokazuje aktivnost na ektopičnim mestima.
Premda je ori sekvenca DHFR jedna od najbolje okarakterisanih ori sekvenci kod
metazoa i u okviru nje definisani funkcionalno značajni regioni (AT bogati... region,
DNR region, BEND, RIP60 region, IR 4 bp), njihova funkcija nije u potpunosti
razjašnjena.
Protein ORC (eng. Origin recognition complex) je heteroheksamer odgovoran
za prepoznavanje mesta inicijacije replikacije. Pretpostavka je da nekoliko
elemenata ima ulogu u prepoznavanju ori sekvence od strane ORC kompleksa kod metazoa.
Funkcija ljudskog proteina Orc4 (HsOrc4) do sad nije u potpunosti
razjašnjena. Našim prethodnim istraživanjima, pokazali smo da HsOrc4 prepoznaje nekanonske strukture i ima sposobnost za utiče na formiranje TAT
tripleksa i homoadeninskih struktura...
Replication is one of the fundamental processes in the life cycle of the cell.
The aim of replication is a duplication of genetic material. To make genetic
material properly duplicated and subsequently divided into daughter cells, a large
number of mechanisms of regulation of replication have been developed. One way
of regulation is the proper selection and activation of replication initiation.
The number and complexity of the origins of replication (ori) varies among
species. They are simpler at evolution lower eukaryotes, while in higher
eukaryotes are more complex. The way of recognizing these places by initiation
proteins is not fully understood.
Ori sequence, located downstream of the DHFR gene (dihydrofolate
reductase) hamster, contains three defined origins of replication: ori β, ori β' and ori
γ. Ori β DHFR sequence is strong replicator and shows activity at ectopic places.
Although the sequence of ori DHFR is one of the best characterized ori sequences in
metazoans and within ...defined functionally important regions (AT rich region,
DNR region, BEND, RIP60 region, IR 4 bp), their function is still not completely
understood.
ORC (Origin recognition complex) is heterohexamer protein responsible for
identifying origins of replication. It is assumed that several elements play a role in
recognizing ori sequences of the ORC complex in metazoans.The function of the human protein Orc4 (HsOrc4) has not been fully
elucidated. Our previous studies showed that HsOrc4 recognize non-canonical
structures and has the ability to influence at formation of TAT triplexes and
homoadenine structures...